こちらの現象について、4.1.5のバージョンでは以下の対処にて解決できました。
1..botファイルの修正
Visual StudioでBotアプリのプロジェクトを開くとxxx.botというファイルがありますが、こちらのservicesのエントリを以下のように記述してください。本来はApp Serviceのアプリケーション設定でアプリケーションIDやパスワードを設定するはずなのですが、これがうまく動作していないようです。
"services": [ { "type": "endpoint", "appId": "<アプリID>", "appPassword": "<パスワード>", "endpoint": "https://<デプロイしたApp ServiceのURL>/api/messages", "id": "<ボットID>", "name": "production" }, { "type": "endpoint", "appId": "", "appPassword": "", "endpoint": "http://localhost:3978/api/messages", "id": "2", "name": "development" } ],
2. ライブラリを以下で指定(これは細かいバージョンによって異なる可能性があります)
・ターゲットフレームワーク:.NET Core 2.1
・Microsoft.Bot.xxx -> 4.1.5
・Microsoft.AspNetCore、Microsoft.AspNetCore.All -> 2.1.6